CrystalMaker X 化學分子建構軟體-生化統計分析軟體/新永資訊有限公司

CrystalMaker X 化學分子建構軟體

CrystalMaker X 化學分子建構軟體

  • CrystalMaker X 化學分子建構軟體
  • 編號
  • 類別
    生化統計分析軟體
  • 介紹
    CrystalMaker X 是一個全新的程序,從頭開始為最新的 Mac 和 Windows 操作系統開發。每一行代碼都經過重新編寫,採用全新的面向對象架構、全新的基於 OpenGL 的圖形引擎、新的界面設計以及全新的、完全集成的結構庫。
  • 價格

CrystalMaker X chemical molecular construction software

What's new in CrystalMaker X
​​​​​​State-of-the-Art 

64-bit multi-processor, multi-touch, multi-structure application.

    • Object-oriented design using native Cocoa (Mac) and
         .NET (Windows) code.

     • 64-bit precision used for all calculations and storage.

     • Multi-processor design for improved performance.

     • Drag-and-drop structures between windows.

    
Built for Mac 

Genuine Mac application, written in Objective-C using Apple's native Cocoa frameworks. The results speak for themselves...

    • Universal Binary: runs natively on Apple Silicon and Intel.

    • Multi-touch rotation and zooming.

    • Haptic feedback: feel the structure as you measure it!

    • Retina display: gorgeous high-resolution graphics.

    • Touch Bar interface for MacBook Pro: rotation dials, sliders,
       contextual controls.

    • Full-screen mode including "Spaces" support.

    • Supports document tabs in macOS 10.12 "Sierra" and later

    • Dedicated Touch Bar interface (MacBook Pro) with controls
       for rotation, scaling, animation,structure building and measu
       rement.

    • Quick Look thumbnails and previews, including multi-
       structure previews.

    • Security-compliant sandboxed application: works with
       system "Gatekeeper"to help keep your Mac safe from
       malware and viruses.
      

Built for Windows 
Genuine native 64-bit Windows application, written in C#
using Microsoft's latest .NET frameworks.

    • Native Windows interface and system performance.

    • High-resolution screen display (e.g., Microsoft Surface Pro).

    • Multi-touch rotation and scaling (e.g., Microsoft Surface Pro).

    • Code-signed application for extra security.
    

Beautiful New Interface 
Maximises productivity in an elegant way.

    • Integrated document window with Structures List, Inspector, 
      Output Log, Tool Strip, Legend and customizable window
      To olbar.

    • Library Browser with animations, structure rotation - and
       a search command.

    • Symmetry Explorer.

    • Packing Explorer: design molecular crystals in real time.

    • Vibrations Explorer: animate vibrational modes & IR
       spectrum.

    • Preferences window with Elements Explorer and
       Periodic Table display.
    

Stunning Pixel-Perfect Graphics 
Beautiful, fast Retina graphics - with transparency.

    • Pixel-perfect OpenGL graphics. Complex intersections
       between multiple objects (e.g., spheres and planes or
       polyhedra) are accurately rendered.

    • High-performance. Take advantage of graphics
      acceleration on your computer's graphics card to
      speed manipulation.

    • Customizable reflectivity and up to 4 light sources.

    • High-DPI "Retina" display on Mac (iMac and MacBook
       /Pro with Retina display) and Windows (e.g., Microsoft
       Surface Pro).

    • Rich-text annotations with subscripts and superscripts.
       Change fonts,colours, styles, sizes and  baselines
       (super/subscripts) within any annotation, for beautiful
       captions and titles.

    • Vector graphics output using PDF and EPS (Mac) or XPS
       (Windows).

    • Export high-resolution graphics with transparent
       backgrounds. 
       TIFF and PNG files have the option of using a
       transparent background.
      

Real-Time Editing 
Inspectors make structure editing a breeze.

    • Info Inspector displays rich-text notes plus
       detailed structural information such as chemical
       formula, numbers of visible atoms, symmetry, etc.
       - which are updated on-the-fly.

    • Atoms Inspector displays all of the atoms or
       structural sites,grouped by chemical element
      (or by molecule, or ungrouped, if required).
      Clicking on the atom preview displays a popover
      for editing sphere, ellipsoid or polyhedral styles.
      Multiple rows in the can be selected to speed up
      editing. A contextual menu
      provides powerful commands, including automatic
      colouring and the ability to switch between preset
      atomic radii sets.

    • Bonds Inspector combines bond specifications with
       style control- and automatic labelling. Coordination
       information is displayed on the right-hand side.

    • Volume Inspector lets you manage multiple lattice planes
       and volumetric datasets.

    • Model & Rendering Inspectors let you adjust all
       aspects of your model's display. Contextual menus
       in each control group let you customize your preferences,
       reset styles, or apply the current settings to all structures
       in the document.

    • Selection Inspector is displayed whenever one or more
       objects (atoms, bonds, polyhedra, annotations, vectors)
        are selected.Youcan simply point and click on an object,
        then use the Inspector to edit the object's settings. The
        Inspector changes, depending on what is selected.
        Powerful "Actions" popup menus allow you to propagate
        your changes to symmetry-related atoms or bonds, isolate
        your selection,and much more.

    • A new Cluster button, in the window toolbar, lets you edit
       a spherical
      cluster interactively: changing the centre point and its
      minimum and maximum radii.
      

Multi-Structure Visualization 
Save multiple structures in the same window to make rotatable animations,
interactive slideshows - or superimpose structures to create interfaces,domain boundaries or explore docking.

    • Drag-and-drop structures between windows.

    • Fast multi-structure animation.

    • Compare differences between two or more structures
       on screen.

    • Create multi-structure crystal interfaces without having
       to merge them.

    • Multi-structure synchronization with atomistic-level control.

    • Rotate animations in real time.

    • Animation playback controls with "scrubber" bar for
      rapidly scanning 
      through extended structure sequences/trajectories.
      

Flexible Bonding 
Amazing new bond styles with secondary option for
saved distance measurements or to show inter-
molecular bonding.

    • 14 stylized ("2D") and 10 photo-rendered ("3D") bond styles.

    • Double-, triple-, segmented- and dotted-bonds.

    • Primary or secondary bonds.

    • Bond distance labels.

    • Thin bond cylinder option.
    

New Sphere Styles 
Pie chart, fuzzy and variable translucency.

    • Visualize disordered or partial occupancy with
      "Pie-chart" spheres: coloured or translucent sectors.

    • "Fuzzy" sphere option with translucency.

    • Slider control for sphere translucency.

    • Defect symbols and emoji styles.
    

Powerful Polyhedra 
Concave, curved, customizable.

    • Concave polyhedra with curved faces.

    • Ellipsoids in polyhedra.

    • Control over polyhedral frame widths.

    • Specify opacity for translucent styles.

    • Control out-of-plane tolerance for many-vertex faces.
    

Multiple Lattice Planes 
A litany of lattice planes in any orientation

    •Multiple lattice planes.

    • Parallel lattice plane sets.

    • Display of symmetry-related planes.

    • Automatic lattice slab generation.
    

New File Formats 
CrystalMaker X can import data from 15 new formats:-

    • 3ED Volumetric

    • CASTEP Cell

    • CASTEP Volumetric (chdiff_fmt, den_fmt, elf_fmt formats)

    • CASTEP Output (includes all frames in the trajectory)

    • Gaussian CUBE

    • DEN volumetric

    • DL_POLY Config and Revcon formats (plus existing
       History import)

    • Generic voxel (volumetric) data

    • GRD volumetric data files

    • GULP (loads input, output structures plus any
       volumetric data)

    • RMCprofile

    • VASP Trajectory (XDATCAR)

    • VASP Volumetric (ELK, CHK, CHGCAR)

    • XCrySDen XSF

    • XCrySDen AXSF
    
CrystalMaker X can export data to 6 new formats:-

    • CASTEP Cell

    • DL_POLY Config

    • Generic voxel (volumetric) data

    • GRD volumetric data files
    
    • RMCprofile
    
    • VASP
    

Packing Explorer 
Turn any molecule into a molecular crystal - interactively.

    • Interactive preview lets you rotate and scale the 
      proposed molecular crystal, change the number of
      unit cells shown, and explore different model types 
      (e.g., switch between ball-and-stick or space-filling).

    • Rotate the molecule relative to the unit cell axes.

    • Change the position of the molecule within the unit cell.

    • Edit symmetry - with real-time preview.


Symmetry Explorer 
Browse symmetry relationships in 3D.

    • Visualize general-equivalent positions in 3D, with cell 
       dividers and full rotation control.

    • Space group popover, with preview.

    • Slider controls to edit the general-equivalent position 
       (e.g., to move to a "special" position).
      

Volumetric Data 
Combine your crystal structure(s) with multiple 3D datasets 
in the same window - with gorgeous rendering.

    • Work with multiple datasets in the same window.

    • View 3ED, CASTEP, CUBE, DEN, GRD, GULP, VASP, Voxel data.

    • Specify range limits as relative or absolute values.

    • Real-time range slider with histogram preview.

    • Mean, median, middle, mid-range or full-range presets.

    • Iso-surfaces or volumes with colour or gradient display.

    • Point clouds with variable size or colour gradient.

    • Multiple lattice-plane slices, with translucency.


New Simulation Engine 
Energy-based refinement for faster, accurate modelling.

    • True energy-minimization algorithm (not just structure
       optimization).

    • Extensive new potentials library for a wide range of
      bonding configurations.

    • Two-stage process: Monte Carlo followed by Least
       Squares for greater finesse. 
   

Crystal Engineering 
Collapse supercells, show twins, interpolate structures.

    • New "Collapse Supercell" feature - ideal for
       visualizing atomic disorder,especially with
       the new Atomistic Density display.

    • Reflect lattice to show twinning.

    • Interpolate between any two selected structures,
       or between all (unselected) structures. Specify
       arbitrary number of interpolationlevels. Ideal for generating
       smooth animations.

    • Generate lattice slabs using a pair of lattice planes.

    • Merge one selected structure into another.


Calculations 
Calculate electron density, porosity, cavities and much more.

    • Electron density maps for any crystal.

    • Porosity value, or 3D porosity maps - visualize "
       negative" (void) or "positive" (filled) space.

    • Distance Map: ideal for working with cavity/
       channel structures.

    • Cavity Finder: with optional generation of
       appropriately-sized cavity sites.

    • D-Spacing Calculator.

    • Van-der-Waals surface.

    • Solvent-excluded surface with user-defined
       probe-sphere radius.

    • Molecular Centroids: simplifies complex
       molecular crystals using dummy sites as
       molecular proxies.

    • Least-squares best-fit plane through points
       (improves on previous versions of the
       program to give consistent, accurate results).

    • Best-fit line through points.

    • Energy (molecule).

    • Vibrational modes (molecule) - with
      dynamical visualizations in the 
      Vibrations Explorer, video output and
      option of text (eigenvectors etc.)
      export.

    • Infra-Red Spectrum (molecule) - with
      customizable display (absorbance/
      transmittance; increasing/decreasing x, etc.).


Integrated Structures Library 
1200 annotated and searchable structures - with space for more.

    • Reference collection with 1200 structures, including
      400+ rock-forming minerals.

    • Examples collection, showcasing the program's functionality.

    • Teaching collection with crystal-chemical "type" structures.

    • Thematic collection including food, fuel, energy materials.

    • Browse recent files.

    • Organise your own structures into custom folders.

    • Automatic thumbnail generation for CIF and other text files.

    • Search by title, notes, chemical formula.

    • Interactive previews with auto-rotation and animation.


And so Much More... 
Bond labels, rotatable measurements, legend...

    • Colour-by-Molecule command.

    • Legend. A key to the atoms in your structure, the Legend
       can be dragged to different parts of the window or
       hidden entirely.

    • Preserve molecular coordinates as you rotate.
       CrystalMaker provides
       both screen coordinates and your original structural
       coordinates.

    • Flexible range generation: specify whatever range limits
       you require,without them being reset (earlier versions of
      the software required all range limits to start at the origin,
      resetting negative values; the new program has no such
      limitatins).

    • Emphasize front cell edges. Sometimes it is difficult to
       infer which edges are the front edges, and which are
       the back. With the Emphasize Front Edges option in
       the Model Inspector, the front edges are emphasized
       with thicker lines than the back edges, thereby making
       the cell orientation clearer.

    • Coloured unit cell faces. Whilst the unit cell is generally
       represented by its edges, you have the option of
       displaying its faces in any colour and transparency.

    • Selectable bonds. Simply click on any bond with the
       Arrow tool and it will appear selected. The bond
       properties are then displayed in the Selection 
       Inspector, for easy editing.

    • Edit bond specifications from a selected bond. You
       can edit the properties of any selected bond (in the Selection
       Inspector) and then apply your changes to all bonds which
       share the same bond specification. Alternatively, you can
       select a bond and use the Selection Inspector's Show in
       Bonds Inspector command to go directly to the
       corresponding bond specification.

    • Select symmetry-related bonds. The Selection Inspector
       lets you take any selected bond and offers the option
       of selecting all symmetry-related bonds.

    • Selectable atom rows in the Atoms Inspector. One or
       more rows can be selected(command-click to make
       a discontinous selection) in the list; you can then use
       the contextual menu to select the corresponding atoms
       on the screen.

    • Perspective grid. When perspective is in effect, the grid
       changes to show the walls of a bounding box, emphasizing
       how scale varies with depth.

    • Atom search. You can search for an atom or site label in
       the current structure.
       If found, the corresponding row of the Atoms Inspector
       is selected. You can also search for an individual atom
       by entering its atom number in the search field. 
       If the atom is visible, it will be marked selected, and
       its properties displayed in the Selection Inspector.

    • Axial vectors can be dragged to different parts of the screen.

    • Width and height of rectangular selection is displayed
       when you click-and-drag with the Arrow tool.

    • Add Title command: You can have a structure's name
      automatically displayed as a new annotation object, using
      this command from the Model menu. The title is displayed
      in one of six positions in the graphics pane (which you can
      customize using the Preferences panel). Holding down the
      shift key adds titles to add structures in the Structures List:
      invaluable when working with many frames from a simulation
     or strucure sequence.

    • Edit position and size of annotations by entering
      numeric values in the Selection Inspector.

    • Edit atom or site labels directly in the Atoms Inspector
       (or Site Inspector),
      without having to use the Crystal or Molecule editors.

    • Separate Bond Angle & Torsion Angle tools. Owing to
       public demand, we have reinstated the Torsion Angle
       Tool as a separate tool in its own right. 
       (In CrystalMaker 9 this tool had been merged with
       the Bond Angle tool.)

    • Create bonds using the Distance Tool. When measuring
       bond distances, a popup window allows creation of a
       bond using the Distance Tool.

    • Rotatable Distance & Angle Measurements. You can
       now rotate and scale your structure without losing
       your Bond Distance, Bond Angle or Torsion
      Angle measurements.

    • Add Atom Tool with live distance display. Holding
      down the shift key when using the Add Atom tool
      displays a labelled preview of the bond to be nserted
      between the last-clicked atom to the current mouse position.

    • Labelled Bond Distances. Bond distances can now be
      preserved as "Distance
      Measurements" (which are secondary bonds, displayed
      with a dotted line style)
      with the bond distance shown alongside.

    • Smart "Bend Selection" command for nanotube generation;
       removes overlapping atoms.

    • New atom labelling options: x, y, z-coordinate; fractional
      height.

    • Online video tour.

 

系統需求

Windows 
OS:

CrystalMaker 10 for Windows is distributed as a compressed Microsoft-Installer package, ready for auto-run.
• Windows 10 (recommended)
• Windows 8
• Windows 7

• 64-bit PC running Windows 7 or later.
• Graphics card with OpenGL 3.2 (or later) capability.

HD:
• 1 GB free disc space.
RAM:
• 4 GB RAM.
 Mac 
OS:

CrystalMaker 10.6 for Mac is a Universal Binary which runs
natively on Apple Silicon as well as older, Intel-based Macs.

 As a bundled application all program resources, online help,
 tutorial and user's guide are saved inside a single application
 icon, making for easy drag-and-drop installation.
• macOS 11.x "Big Sur" (recommended)
• macOS 10.15 "Catalina"
• macOS 10.14 "Mojave"
• macOS 10.13 "High Sierra"
• macOS 10.12 "Sierra"

 Apple Silicon or Intel Mac running macOS 10.12.2 "Sierra"or
later through to macOS 11.x "Big Sur"

HD:
• 1 GB free disc space.
RAM:
• 4 GB RAM.

 

CrystalMaker X 化學分子建構軟體

CrystalMaker X中的新功能
​​​​​​最先進的技術 

64位元多處理器、多點觸控、多結構應用。

    • 使用原生的 Cocoa (Mac) 和 .NET (Windows) 代碼的面向
​         ​​​​​​對象設計。

     • 64 位元精度用於所有計算和存儲。

     • 多處理器設計以提高性能。

     • 窗口之間的拖放結構。

     
專為 Mac 打造
真正的 Mac 應用程序,使用 Apple 的原生 Cocoa 框架用
Objective-C 編寫。結果不言自明...

    • 通用二進制:在 Apple Silicon 和 Intel 上本地運行。

    • 多點觸控旋轉和縮放。

    • 觸覺反饋:在測量時感受結構!

    • Retina 顯示屏:華麗的高分辨率圖形。

    • MacBook Pro 的觸控欄界面:旋轉撥盤、滑塊、上下文控件。

    • 全屏模式,包括“空格”支持。

    • 支持 macOS 10.12 "Sierra" 及更高版本中的文檔標籤

    • 專用觸控欄界面 (MacBook Pro),帶有旋轉、縮放、動畫、
       結構構建和測量控件。

    • 快速查看縮略圖和預覽,包括多結構預覽。

    • 符合安全標準的沙盒應用程序:與系統“Gatekeeper”配合使用,
       幫助您的 Mac 免受惡意軟件和病毒的侵害。


專為 Windows 打造
真正的原生 64 位 Windows 應用程序,使用 Microsoft 最新的 .NET 框架用 C# 編寫。

    • 本機 Windows 界面和系統性能。

    • 高分辨率屏幕顯示(例如,Microsoft Surface Pro)。

    • 多點觸控旋轉和縮放(例如,Microsoft Surface Pro)。

    • 代碼簽名的應用程序以提高安全性。


漂亮的新界面
以優雅的方式最大限度地提高生產力。

    • 帶有結構列表、檢查器、輸出日誌、工具條、
​​​       ​​​​圖例和可自定義窗口工具欄的集成文檔窗口。

    • 帶有動畫、結構旋轉和搜索命令的庫瀏覽器。

    • 對稱瀏覽器。

    • Packing Explorer:實時設計分子晶體。

    • 振動資源管理器:動畫振動模式和紅外光譜。

    • 帶有元素資源管理器和周期表顯示的首選項窗口。


令人驚嘆的像素完美圖形
漂亮、快速的 Retina 圖形 - 具有透明度。

• 像素完美的 OpenGL 圖形。多個對象(例如,球體和平面或多面體)
   之間的複雜交叉點被準確渲染。

• 高性能。利用計算機圖形卡上的圖形加速來加快操作速度。

• 可定制的反射率和多達 4 個光源。

• Mac(iMac 和配備 Retina 顯示屏的 MacBook/Pro)和
   Windows (例如 Microsoft Surface Pro)上的高 DPI“Retina”
   顯示屏。

• 帶有下標和上標的富文本註釋。更改任何註釋中的字體、顏色、
​   ​​​​​​樣式、大小和基線(上標/下標)以獲得漂亮的標題和標題。

• 使用 PDF 和 EPS (Mac) 或 XPS (Windows) 輸出矢量圖形。

• 導出具有透明背景的高分辨率圖形。TIFF 和 PNG 文件可以
​​   ​​​​​選擇使用透明背景。


即時編輯
檢查員使結構編輯變得輕而易舉。

    • Info Inspector 顯示富文本註釋以及詳細的結構信息,
​​       ​​​​​例如化學式、可見原子的數量、對稱性等 - 即時更新。

    • AtomsInspector顯示所有原子或結構位點,按化學元素分組
      (或按分子分組,或未分組,如果需要)。      
       單擊原子預覽會顯示一個用於編輯球體、橢圓體或多面體樣式的
​​     ​​​​​  彈出窗口。可以選擇多行以加快編輯速度。
       上下文菜單提供了強大的命令,包括自動著色和在預設原子半徑
       集之間切換的能力。

    • Bonds Inspector 結合了債券規範和样式控制 - 以及自動貼標。
​​      ​​​​​坐標信息顯示在右側。

    • Volume Inspector 可讓您管理多個晶格平面和體積數據集。

    • 模型和渲染檢查器可讓您調整模型顯示的所有方面。每個控制組
​​       ​​​​中的上下文菜單讓您可以自定義首選項、重置樣式或將當前設置
​       ​​​​​​應用於文檔中的所有結構。

    • 每當選擇一個或多個對象(原子、鍵、多面體、註釋、向量)時,
​​​       ​​​​就會顯示選擇檢查器。您可以簡單地指向並單擊對象,然後使用檢
​​​​       ​​​查器來編輯對象的設置。Inspector 會根據選擇的內容而變化。強
       大的“操作”彈出菜單允許您將更改傳播到與對稱相關的原子或鍵,
​​       ​​​​​隔離您的選擇等等。

    • 窗口工具欄中的新集群按鈕可讓您以交互方式編輯球形集群:更改中
​       ​​​​​​心點及其最小和最大半徑。 

      
多結構可視化
在同一窗口中保存多個結構以製作可旋轉動畫、交互式幻燈片 - 或疊加結構以創建界面、域邊界或探索對接。

    • 窗口之間的拖放結構。

    • 快速的多結構動畫。

    • 比較屏幕上兩個或多個結構之間的差異。

    • 無需合併即可創建多結構晶體界面。

    • 具有原子級控制的多結構同步。

    • 實時旋轉動畫。

    • 帶有“scrubber”欄的動畫播放控件,用於快速掃描
       擴展結構序列/軌跡。 

      
靈活的粘接
驚人的新鍵樣式,帶有用於保存距離測量或顯示分子間鍵合的輔助選項。

    • 14 種程式化(“2D”)和 10 種照片渲染(“3D”)粘合樣式。

    • 雙鍵、三鍵、分段鍵和點鍵。

    • 主要或次要債券。

    • 鍵距標籤。

    • 薄鍵合滾筒選項。 


新球體樣式
餅圖、模糊和可變半透明度。

    • 使用“餅圖”球體可視化無序或部分佔用:彩色或半透明扇區。

    • 半透明的“模糊”球體選項。

    • 球體半透明的滑塊控件。

    • 缺陷符號和表情符號樣式。 

   
強大的多面體
凹面,彎曲,可定制。

    • 具有曲面的凹多面體。

    • 多面體中的橢圓體。

    • 控制多面體框架寬度。

    • 指定半透明樣式的不透明度。

    • 控制多頂點面的平面外容差。

    
多個晶格平面

任意方向的一連串晶格平面

    • 多個晶格平面。

    • 平行晶格平面集。

    • 顯示與對稱相關的平面。

    • 自動格子板生成。


新文件格式
CrystalMaker X 可以從 15 種新格式導入數據:-

    • 3ED 體積

    • CASTEP單元

    • CASTEP 體積(chdiff_fmt、den_fmt、elf_fmt 格式)

    • CASTEP 輸出(包括軌跡中的所有幀)

    • 高斯立方體

    • DEN 體積

    • DL_POLY 配置和 Revcon 格式(加上現有的歷史導入)

    • 通用體素(體積)數據

    • GRD 體積數據文件

    • GULP(加載輸入、輸出結構以及任何體積數據)

    • RMC簡介

    • VASP 軌跡 (XDATCAR)

    • VASP 體積(ELK、CHK、CHGCAR)

    • XCrySDen XSF

    • XCrySDen AXSF

CrystalMaker X 可以將數據導出為 6 種新格式:-

    • CASTEP單元

    • DL_POLY 配置

    • 通用體素(體積)數據

    • GRD 體積數據文件

    • RMC簡介

    • VASP

包裝瀏覽器
將任何分子變成分子晶體 - 交互。

    • 交互式預覽可讓您旋轉和縮放建議的分子晶體,更改顯示的晶胞
​       ​​​​數量,並探索不同的模型類型(例如,在球棒或空間填充之間切
​​       ​​​​​換)。

    • 相對於晶胞軸旋轉分子。

    • 改變分子在晶胞內的位置。

    • 編輯對稱性 - 實時預覽。


對稱瀏覽器
瀏覽 3D 中的對稱關係。

    • 可視化 3D 中的一般等效位置,具有細胞分隔器和完全旋轉控制。

    • 空間組彈出窗口,帶預覽。

    • 滑塊控件以編輯一般等效位置(例如,移動到“特殊”位置)。


體積數據
在同一窗口中將您的晶體結構與多個 3D 數據集相結合 - 具有華麗的渲染。

    • 在同一窗口中處理多個數據集。

    • 查看 3ED、CASTEP、CUBE、DEN、GRD、GULP、
       VASP、體素數據。

    • 將範圍限制指定為相對值或絕對值。

    • 帶有直方圖預覽的實時範圍滑塊。

    • 均值、中值、中值、中檔或全檔預設。

    • 具有顏色或漸變顯示的等值面或體積。

    • 具有可變大小或顏色漸變的點雲。

    • 多個晶格平面切片,具有半透明性。


新的模擬引擎
基於能量的改進可實現更快、更準確的建模。

    • 真正的能量最小化算法(不僅僅是結構優化)。

    • 適用於各種鍵合配置的廣泛的新電位庫。

    • 兩階段過程:Monte Carlo 之後是最小二乘法以獲得更好的技巧。


晶體工程
折疊超胞,顯示雙胞胎,插入結構。

    • 新的“折疊超級單元”功能 - 非常適合可視化原子無序,
​​​        ​​​​尤其是新的原子密度顯示。

     • 反射晶格以顯示孿晶。

     • 在任意兩個選定結構之間或所有(未選定)結構之間進行插值。
​​​        ​​​​指定任意數量的插值級別。非常適合生成流暢的動畫。

    • 使用一對晶格平面生成晶格板。

    • 將一個選定的結構合併到另一個結構中。


計算
計算電子密度、孔隙率、空穴等。

    • 任何晶體的電子密度圖。

    • 孔隙度值或 3D 孔隙度圖 - 可視化“負”(空隙)或“正”(填充)
​​       ​​​​​空間。

    • 距離圖:非常適合處理腔體/通道結構。

    • 腔體查找器:可選擇生成適當大小的腔體位置。

    • D-間距計算器。

    • 范德瓦爾斯曲面。

    • 具有用戶定義的探針球半徑的無溶劑表面。

    • 分子質心:使用虛擬位點作為分子代理來簡化複雜的分子晶體。

    • 通過點的最小二乘最佳擬合平面(改進了以前版本的程序以提供
       一致、準確的結果)。

    • 通過點的最佳擬合線。

    • 能量(分子)。

    • 振動模式(分子) - 在振動資源管理器中具有動態可視化、
       視頻輸出和文本(特徵向量等)導出選項。

    • 紅外光譜(分子) - 具有可定制的顯示(吸光度/透射率;
​​​​       增加/減少 x 等)。


集成結構庫
1200 個帶註釋和可搜索的結構 - 有更多空間。

    • 包含 1200 個結構的參考集合,包括 400 多種造岩礦物。

    • 示例集合,展示程序的功能。

    • 具有晶體化學“類型”結構的教學集。

    • 主題收藏包括食品、燃料、能源材料。

    • 瀏覽最近的文件。

    • 將您自己的結構組織到自定義文件夾中。

    • CIF 和其他文本文件的自動縮略圖生成。

    • 按標題、註釋、化學式搜索。

    • 帶有自動旋轉和動畫的交互式預覽。


還有更多...
債券標籤、可旋轉測量、圖例...

    • 按分子顏色命令。

    • 傳奇。作為結構中原子的關鍵,圖例可以拖動到窗口的
​       ​​​​​​不同部分或完全隱藏。

    • 旋轉時保留分子坐標。CrystalMaker 提供屏幕坐標和原始結構坐標。

    • 靈活的範圍生成:指定您需要的任何範圍限制,而無需重置它們
       (早期版本的軟件要求所有範圍限制從原點開始,重置負值;
​       ​​​​​​新程序沒有此類限制)。
    
    • 強調前面的單元格邊緣。有時很難推斷哪些邊緣是前邊緣,
       哪些是後邊緣。
       使用模型檢查器中的“強調前邊緣”選項,前邊緣會用比後邊緣
​​       ​​​​​更粗的線條來強調,從而使單元格方向更清晰。

    • 彩色晶胞面。雖然晶胞通常由其邊緣表示,但您可以選擇以任何
       ​​​​​​顏色和透明度顯示其面。

    • 可選擇的債券。只需使用箭頭工具單擊任何鍵,
       ​​​​​​它就會顯示為選中狀態。然後鍵屬性會顯示在選擇檢查器中,
​​​       ​​​​以便於編輯。

    • 從選定的債券編輯債券規範。您可以編輯任何選定債券的屬性
      (在選擇檢查器中),然後將更改應用於共享相同債券規格的
​​       ​​​​​所有債券。或者,您可以選擇一個鍵並使用選擇檢查器的
       Show in Bonds Inspector 命令直接轉到相應的鍵規範。

    • 選擇與對稱相關的鍵。選擇檢查器讓您可以選擇任何選定的債券,
​​​       ​​​​並提供選擇所有對稱相關債券的選項。

    • 原子檢查器中的可選原子行。可以在列表中選擇一行或多行
      (命令單擊以進行不連續的選擇);然後您可以使用上下文菜單在
​       ​​​​​屏幕上選擇相應的原子。

    • 透視網格。當透視生效時,網格會發生變化以顯示邊界框的牆壁,
       強調縮放如何隨深度變化。

    • 原子搜索。您可以在當前結構中搜索原子或位點標籤。如果找到,
​       ​​​​​​則選擇 Atoms Inspecto 的相應行。您還可以通過在搜索字段中
​       ​​​​​​輸入原子編號來搜索單個原子。如果原子可見,它將被標記為選中,
​​       ​​​​​並且其屬性顯示在選擇檢查器中。

    • 軸向矢量可以拖動到屏幕的不同部分。

    • 當您使用箭頭工具單擊並拖動時,將顯示矩形選擇的寬度和高度。

    • 添加標題命令:您可以使用模型菜單中的此命令將結構名稱自動
​       ​​​​​​顯示為新的註釋對象。標題顯示在圖形窗格中的六個位置之一
​      ​​​​​​(您可以使用首選項面板自定義)。按住 shift 鍵添加標題以在結構
​​       ​​​​​列表中添加結構:在處理來自模擬或結構序列的許多幀時非常有用。

    • 通過在選擇檢查器中輸入數值來編輯註釋的位置和大小。

    • 直接在 Atoms Inspector(或 Site Inspector)中編輯原子或站點
​​​       ​​​​標籤,而無需使用 Crystal 或 Molecule 編輯器。

    • 單獨的接合角和扭轉角工具。由於公眾的需求,我們已將扭轉角工具
​​       ​​​​​恢復為獨立的工具。(在 CrystalMaker 9 中,此工具已與鍵角工具
​​​       ​​​​合併。)

    • 使用距離工具創建鍵。測量鍵距離時,彈出窗口允許使用距離工具創
       建​鍵。

    • 可旋轉距離和角度測量。您現在可以旋轉和縮放結構而不會丟失鍵
​       ​​​​​​距、鍵角或扭轉角測量值。

    • 添加具有實時距離顯示的原子工具。使用 Add Atom 工具時按住
       shift 鍵會顯示要在最後單擊的原子和當前鼠標位置之間插入的鍵
​​       ​​​​的標記預覽。

    • 標記的鍵距離。鍵距離現在可以保留為“距離測量”(這是次鍵,
​       ​​​​​​以虛線樣式顯示),鍵距​​離顯示在旁邊。

    • 用於納米管生成的智能“彎曲選擇”命令;去除重疊的原子。

    • 新的原子標記選項:x、y、z 坐標;分數高度。


 

BioNumerics 8.0 生物類緣關係分析軟體

BioNumerics的特性之一是包含了一個整合了針對於各種現有的生物學數據的分析模塊的關係型數據庫。本系統除了提供了強大的,對輸入數據的類型和大小沒有限制的多用戶的環境,同時提供了現有最先進的對凝膠圖譜,指紋圖譜,序列信息等的分析工具。數據庫裡面的數據記錄,可以是細菌或者是病毒菌株,動物,植物,真菌,或任何器官的指紋圖譜樣本。同時,不同的試驗方法來的樣本也可以定義在同一個數據庫的記錄中。利用本系統,用戶可以對多種試驗數據的不同的記錄之間進行研究比較,並對不同的記錄通過整合進行分類鑑定。

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The COSMO-RS method has proven the σ-profiles as the crucial information for most ADME properties as solubility, blood-brain-partition coefficients, and intestinal absorption, and even for many adsorption phenomena. Considering this fundamental importance of the σ-profiles for surface interactions of molecules in liquid states, they most likely also carry a large part of information required for the estimation of desolvation and binding processes, which are responsible for the inhibition of enzyme receptors by drug molecules. Thus a high similarity with respect to the σ-profiles appears to be

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