CANOCO 5 生態排序分析軟體
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類別研究分析軟體
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介紹Canoco 5是 2012 年 10 月發佈的最新、備受重裝的卡諾科軟體版本。本網站為您提供了對有效使用軟體的其他資源的訪問，以及 Canoco 5 新功能的簡要概述。使用此頁面右側的功能表訪問這些資源。
CANOCO 5 Ecological Sequencing Analysis Software
Analytical and graphing capabilities are integrated with an easy-to-use spreadsheet data editor in a single program. All analyses done on a set of data tables are now collected within a Canoco 5 project, sharing the analytical and graphing settings.
All statistical methods offered by Canoco for Windows 4.5 are available, such as DCA, CA, CCA, DCCA, PCA, and RDA methods - including their partial variants, with Monte Carlo permutation tests for constrained ordination methods, offering appropriate permutation setup for data coming from non-trivial sampling designs.
All visualization tools offered by CanoDraw 4.x are available (including loess, GLM and GAM models for the visualization of data attributes in ordination space) and many of them are improved.
Data can be entered within the program itself or easily imported from Excel (.XLS or .XLSX formats) or from Canoco 4.x data files. Labels no longer need to be shortened to 8 characters, but these brief forms are still available for display in the ordination diagrams and can even be automatically generated from the long ones. Standard coding of factors (categorical predictors) is now used, dummy (0/1) variables are generated internally. The editor allows transformation from dummy variables to factors and, if needed, the reverse.
Principal coordinate analysis (PCoA) and distance based RDA (db-RDA) are now easily accessible, with new distance measures added (11 distance types in total, including Bray-Curtis, Gower distance, or Jaccard coefficients). Similarly, non-metric multidimensional scaling (nMDS) is also supported.
Variation partitioning is easily accessible for two or three groups of predictors including calculations of individual fractions of explained variation, based either on partial or non-partial analyses and using either raw or adjusted variation estimates.
Principal coordinates of neighbour matrices (PCNM) method is available within the variation partitioning framework. Present implementation matches the suggestions described in Legendre & Legendre (2012) under an alternative method name (dbMEM).
Computing, testing and graphing of the Principal Response Curves (PRC) is now an easy task.
產品安裝硬體規格
Windows 8、8.1或10的32位和64位版本、 Windows XP、Windows Vista、Windows 7
CANOCO 5 生態排序分析軟體
分析和繪圖功能與易於使用的電子表格數據編輯器集成在單個程序中。現在，在Canoco 5項目中收集對一組數據表進行的所有分析，共享分析和圖形設置。
Canoco為Windows 4.5提供的所有統計方法均可用，例如DCA，CA，CCA，DCCA，PCA和RDA方法-包括其部分變體，以及用於受約束排序方法的Monte Carlo置換測試，為即將到來的數據提供適當的置換設置來自非平凡的抽樣設計。
CanoDraw 4.x提供的所有可視化工具都可用（包括黃土，GLM和GAM模型，用於在排序空間中可視化數據屬性），其中許多功能得到了改進。
可以在程序本身中輸入數據，也可以輕鬆地從Excel（.XLS或.XLSX格式）或Canoco 4.x數據文件中導入數據。標籤不再需要縮短為8個字符，但是這些簡短的形式仍然可以在順序圖中顯示，甚至可以從長形式中自動生成。現在使用標準的因子編碼（分類預測變量），在內部生成虛擬（0/1）變量。編輯器允許將虛擬變量轉換為因子，如果需要，還可以進行逆向轉換。
現在可以輕鬆訪問主要坐標分析（PCoA）和基於距離的RDA（db-RDA），添加了新的距離度量（總共11種距離類型，包括Bray-Curtis，Gower距離或Jaccard係數）。同樣，還支持非度量多維縮放（nMDS）。
對於兩到三組預測變量，可以輕鬆進行變異分區，包括基於部分或非局部分析以及使用原始或調整後的變異估計值來計算已解釋變異的各個分數。
變體劃分框架中提供了鄰居矩陣的主坐標（PCNM）方法。當前的實現與Legendre＆Legendre（2012）中描述的建議匹配，使用的是備用方法名稱（dbMEM）。
現在，對主響應曲線（PRC）進行計算，測試和繪製圖形是一項輕鬆的任務。
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